Hội thảo nghiên cứu tại IFI ngày 11/4/2013

Thứ hai - 08/04/2013 00:55

Tuần này tại IFI sẽ diễn ra buổi hội thảo do nghiên cứu sinh Bùi Quang Anh (Phòng MSI) trình bày + Ngày: Thứ Năm ngày 11/4/2013+ Thời gian: lúc 14h + Địa điểm: Hội trường IFI + Trình...

Tuần này tại IFI sẽ diễn ra buổi hội thảo do nghiên cứu sinh Bùi Quang Anh (Phòng MSI) trình bày


+ Ngày: Thứ Năm ngày 11/4/2013
+ Thời gian: lúc 14h
+ Địa điểm: Hội trường IFI
+ Trình bày: Bùi Quang Anh - Nghiên cứu sinh phòng nghiên cứu MSI


Tóm tắt:

Tên đề tài : CRIBLAGE VIRTUEL SUR GRILLE DE COMPOSES ISOLES AU VIETNAM
Chủ nhiệm : Vincent BRETON (Giám đốc nghiên cứu, CNRS, Pháp)
Đồng chủ nhiệm : Nguyễn Hồng Quang (Giảng viên, UMI UMMISCO, IFI, Việt Nam) Phạm Quốc Long (INPC, VAST, Việt Nam)


Mô tả dự án :


L’Institut de Chimie des Produits Naturels de l’Académie des Sciences du Vietnam (INPC) collecte des échantillons issus de la biodiversité locale et détermine la structure 3D des molécules isolées. L’enjeu pour cet institut est de constituer une base de données des échantillons et de mettre en place une chaîne de traitement des échantillons pour déterminer sur quelles cibles biologiques les produits isolés sont potentiellement actifs.


Les composants extraits de la biodiversité sont isolés et purifiés. A partir de la structure tridimensionnelle des molécules, il est possible de mettre en place un traitement informatique sur la grille permettant de calculer l’activité putative de ces molécules sur les cibles biologiques stockées dans la base de données PDB. Ce traitement informatique permet de regarder l’intérêt potentiel des nouvelles molécules extraites pour un grand nombre de maladie à coût très réduit.


Le traitement de criblage virtuel a besoin d’une grande puissance de calcul. Alors, on choisit la technologie de grille de calcul dans ce projet. La grille de calcul donne centaines de CPUs à calculer parallélisme. Il peut réduit efficacement le temps de calcul à comparer avec un seul server. Pour gérer des jobs sur la grille de calcul, on utilise des plates-formes existantes comme WPE, DIRAC, GVSS… Avec ces plates-formes, utilisateur peut soumettre facilement son projet sur grille de calcul.


La recherche de ce projet concentre sur l’utilisation de plates-formes dans le problème de criblage virtuel. On trouve la meilleure méthode d’ordonnancement de job pour plates-formes. Et nous expérimentons aussi les plates-formes existantes pour choisir la meilleure plate-forme. Et enfin, nous utilisons les résultats de recherche pour construire le système de criblage virtuel à l’INPC qui va traiter des données Vietnamiennes. Ce system doit être facile à utiliser, efficace, et sécurité.


Rất mong sự quan tâm và tham gia đông đảo!


 
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